職業健康安全管理體系初次審核通常由第一階段審核和第二階段審核兩個階段組成（監督審核和復評不必兩個階段）。

　　第一階段審核：

　　a.審核組長組織第一階段審核組成員對受審核方職業健康安全管理體系文件進行評審。文件評審以GB/T28001標準及職業健康安全法律、法規為審核準則，并出具《文件審查報告》。如發現受審核方職業健康安全管理體系文件中的不符合，應及時通知受審核方糾正。

　　b.與申請組織的職業健康安全管理者代表交談，了解體系運行以及遵守職業健康安全法律法規的情況；

　　c.查閱體系運行的有關記錄；

　　d.現場調查組織的危害源及不可容許的風險；

　　e.在現場結束前，審核組長應與受審核方溝通，通報第一階段審核結論，以發現問題匯總表的形式指出存在的問題，提出糾正的要求。

　　第二階段審核：

　　a.進行現場審核前，首先召開有受審核方領導及有關人員參加的首次會議；

　　b.通過現場審核收集審核證據；

　　c.召開末次會議，宣布第二階段審核結果，編寫審核報告；

　　d.對審核中開具的不符合報告,，受審核方應根據要求進行糾正/采取糾正措施，自行驗證有效后,提交審核組長驗證（驗證的方式有書面驗證和現場驗證兩種）。驗證合格后，審核組長應將審核報告及相關資料報HXQC審核部，審核部審查后，提交中心技術委員會評定，如評定通過，經中心主任批準后正式頒發認證證書。