1 科學性

危險、有害因素的識別是分辨、識別、分析確定系統內存在的危險，而并非研究防止事故發生或控制事故發生的實際措施。它是預測安全狀態和事故發生途徑的一種手段，這就要求進行危險、有害因素識別必須要有科學的安全理論作指導，使之能真正揭示系統安全狀況危險、有害因素存在的部位、存在的方式、事故發生的途徑及其變化的規律，并予以準確描述，以定性、定量的概念清楚地顯示出來，用嚴密的合乎邏輯的理論予以解釋清楚。

2 系統性

危險、有害因素存在于生產活動的各個方面，因此要對系統進行全面、詳細地剖析、研究系統和系統及子系統之間的相關和約束關系。分清主要危險、有害因素及其相關的危險、有害性。

3 全面性

識別危險、有害因素時不要發生遺漏，以免留下隱患，要從廠址、自然條件、總圖運輸、建構筑物、工藝過程、生產設備裝置、特種設備、公用工程、安全管理系統，設施，制度等各方面進行分析、識別；不僅要分析正常生產運轉，操作中存在的危險、有害因素還要分析、識別開車、停車、檢修，裝置受到破壞及操作失誤情況下的危險、有害后果。

4 預測性

對于危險、有害因素，還要分析其觸發事件，亦即危險、有害因素出現的條件或設想的事故模式。