農藥進入人體的主要途徑有三條：皮膚、消化道和呼吸道。不同的農藥，進入人體的途徑可能相同，也可能不同；同一種農藥也可以有多種進入人體的途徑。

皮膚：對于農藥的生產、銷售和使用人員來說，通過皮膚吸收是農藥最常見的進入人體途徑。大部分農藥都可以通過完好的皮膚吸收，而且吸收后在皮膚表面不留任何痕跡，所以皮膚吸收通常也是最易被人們忽視的途徑。當皮膚有傷口時，其吸收量要明顯大于完整皮膚的吸收量。農藥制劑為液體或油劑、濃縮型制劑時皮膚吸收速度更快。

消化道：各種農藥都可以通過消化道吸收進入人體，主要的吸收部位是胃和小腸，而且大多吸收的較為完全。經消化道吸收進入體內的農藥劑量一般較大，中毒病情相對嚴重。

呼吸道：在噴灑和熏蒸農藥時，或是使用一些易揮發的農藥時，都可以經過呼吸道吸入進入人體。直徑較大的農藥粒子不能直接進入肺內，被阻留在鼻、口腔、咽喉或氣管內，并通過這些表面黏膜吸收；只有直徑為1～8微米的農藥粒子才能直接進入肺內，并且被快速而完全地吸收進入體內。